Отсутствие кислорода, незначительные колебания температуры создают для донных отложений особые условия, в которых все живые и отмершие клетки макро- и микроорганизмов подвергаются медленному расщеплению на составные компоненты — аминокислоты и низкомолекулярные пептиды, нуклеотиды и другие высокоактивные биологические вещества.
В озерном сапропеле содержатся белки, жиры, протеин, витамины, гормоны, каратиноиды, антиоксиданты, биостимуляторы роста и ряд других веществ.
Минеральная часть озерного сапропеля содержит макро- и микроэлементы — азот, фосфор, калий, кремний, магний, кальций, серу, бор, марганец, медь, цинк, йод, селен, хром, кобальт, молибден, хром, бериллий и др.
Озёрный сапропель — это продукт донных отложений пресноводных водоёмов, образующийся в результате биотрансформации отмершей растительности, животных организмов, остатков микроорганизмов и почвенно-грунтовых частиц без доступа кислорода.